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Screening of specific microRNAs and bioinformatics analysis on cardiomyocytes in rat with heart failure
作者：朱海娟,何淑芳,金世云,许士进,张野
发布日期：2016-04-07
目的 观察大鼠心力衰竭细胞中microRNA (miRNA)表达变化，利用生物信息学分析技术探索差异miRNA靶基因的功能。 方法 18只成年雄性SD大鼠，体质量200～220 g，随机数字表法随机分为两组：正常对照组(CON组)和心力衰竭组(HF组)。HF组制备阿霉素致心力衰竭模型，CON组注射等量生理盐水。提取大鼠心脏，Largendorff逆行灌注法分离心室肌细胞，提取总RNA行miRNA表达谱检测，筛选两组差异表达的miRNA，荧光定量RT- PCR 技术验证结果， Targetscan、miRanda软件预测差异表达miRNA的靶基因，并对靶基因行生物信息学分析。 结果 芯片检测结果显示，与CON组相比，HF组共有37个miRNA表达发生显著改变，其中22个miRNA上调，15个miRNA下调(均P<0.01，FDR<0.05)。荧光定量RT- PCR检测miR-133b-5p (t=14.56，P<0.1)、 miR-6216 (t=9.32，P<0.1)、let-7e-5p (t=13.92，P<0.1)表达水平，变化趋势与芯片结果一致。生物信息学分析显示，差异表达miRNA调控的靶基因显著富集于31个基因组(均P<0.01，FDR<0.05)和12条信号通路(均P<0.05，FDR<0.05)，其中泛素蛋白酶体系统、MAPK信号通路、Toll样受体信号通路富集程度较高。 结论 阿霉素诱导的心力衰竭模型大鼠心肌细胞中miRNA表达谱发生显著改变，这些差异表达miRNA可能通过调控靶基因功能参与心力衰竭的病理生理过程。
朱海娟,何淑芳,金世云,许士进,张野. 慢性心力衰竭大鼠心肌细胞microRNA表达谱及生物信息学分析[J]. 中华急诊医学杂志, ,: 439-443.DOI号:
基金项目：国家自然科学基金青年基金(81200171)；安徽省科技厅年度重点项目(1301043031)
关键词： 心力衰竭 心肌细胞 microRNA 表达谱 生物信息学分析
