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Gene chip screen in mice kidney with acute paraquat poisoning and preliminary analysis of the differentially expressed genes
作者：陈亮,李昌斌,胡大勇,李新华,王贞,王菱,彭艾 发布日期：2015-11-02
目的：应用基因芯片技术研究百草枯中毒小鼠模型肾脏损伤基因表达谱，通过基因信息学分析筛选核心基因，并以分子生物学方法给予验证。方法：C57BL/6雄性小鼠20只，随机（随机数字法）分成4组，分别为对照组（A组）和染毒组（B、C、D组），每组5只。A组蒸馏水0.01 mL/g体质量灌胃，B、C、D组20%百草枯原液加蒸馏水稀释至0.05%，按0.01 mL/g体质量灌胃。A组于灌胃后即刻处理，B、C组分别于染毒6 h、24 h处理，D组观察48 h病死率，处理方法为麻醉后取出右肾组织样本，Affymetrix GeneChip Mouse Gene 1.0 ST Array芯片技术测定肾脏组织的基因表达谱，通过基因信息学分析筛选核心基因，并进行实时定量PCR和Western blot验证。结果：PQ灌胃后体质量明显下降，48 h病死率为100％。与对照组相比，PQ中毒6 h组、24 h组共有1 792个差异表达基因，基因信息学分析筛选出8个核心基因：Nlrc5、Serpinb9、Cd40、Rnf135、Dhx58、Sp110、Fcgr1、Arhgef12，进行PCR验证。Nlrc5、Rnf135、Serpinb9基因表达的差异有统计学意义（P＜0.05）。再对Nlrc5、Rnf135、Serpinb9进行Western blot验证。均与对照组比较，中毒6 h组，Nlrc5、Rnf135、Serpinb9表达上调差异有统计学意义（P＜0.05），中毒24 h组，Rnf135、Serpinb9表达上调差异有统计学意义（P＜0.05），Nlrc5表达下调差异有统计学意义（P＜0.01）。不仅与基因芯片检测、信息学分析的结果一致，还证实了Nlrc5表达先上调（6 h）后下调（24 h）。结论：Nlrc5、Rnf135、Serpinb9是急性百草枯中毒小鼠肾脏损伤的核心基因，其参与肾脏损伤的具体机制有待进一步研究。
陈亮,李昌斌,胡大勇,李新华,王贞,王菱,彭艾. 百草枯中毒小鼠肾脏损伤核心基因研究[J]. 中华急诊医学杂志, 2015,24(11): 1208-1213.DOI号:10.3760/cma.j.issn.1671-0282.2015.11.005
基金项目：国家自然科学基金（81270136；81101414；81301626）
关键词： 百草枯中毒 肾脏损伤 基因芯片 生物信息学 机制
